警方為應(yīng )付未確認生命(mìng )體而(ér )開(🐌)發(🍩)了(le )G3系統，這套G3系(🤢)統是根(🎺)據未確(què )認(🆖)生(shēng )命體4號即幪面超人古迦的力量而設計出來，裝(zhuāng )著員是一(yī )位叫冰川誠的警(jǐng )(🎩)員，為(wéi )人真誠但略為粗獷。警方另一部門在荒(📞)島上發現(🗑)了(le )古(🍮)代文(🙁)明，並(bìng )進行解碼。當未(wèi )確(🤷)認(🔊)生命體(🚢)再次出現，連G3也(yě )(🚨)不是其對手(shǒu )時(shí )，神秘(🌑)的金色(㊗)幪面超人亞極(📙)陀(tuó )登場，這個(🤠)幪面(miàn )(🌞)超人是一位失憶的青年津上翔一(🤷)變(biàn )身，起初因(🕙)未能控(kòng )制(👺)而(ér )襲擊G3。
　　翔一(yī )暫住在美杉義(yì )彥的家，認(🛎)識(shí )了擁有超能力的(🏻)風谷(gǔ )真魚，真魚(yú )更幫(bāng )助翔一四出尋找他(😝)失去的(de )記憶，並遇上葦原(😙)涼。涼在父親(💏)的遺物(wù )中，發(💸)現(xiàn )一本記事(shì )薄，當(dāng )中提及(jí )(🔙)之姓(xìng )名(míng )卻無人知曉，查(chá )探(tàn )父親(🏓)死(🚽)因後(hòu )，竟(jìng )(👛)發(🕕)現(😳)自己是(📤)另(🚻)一個幪面超人－磯(🧘)烙使(🤼)。磯烙(lào )使(shǐ )是不(🎴)完整(zhěng )的亞極陀，所以當涼變身磯烙使後(hòu )(🍯)會出現(xiàn )後(hòu )遺証。有(yǒu )次他(👼)相當危險，幸得因超古代文(🕵)明遺傳因子而誕(🔍)生的青年(nián )所救。之後出現的(🐸)未確認生(👔)命體也相繼被(bèi )(🦐)翔一，涼(liáng )以(yǐ )(⏭)及(jí )(🍗)誠所打(dǎ )敗。
　　後來，涼誤會女朋(péng )友是被亞極陀(tuó )所殺，造成磯(👎)烙(❗)使與(😓)亞(yà )(🔚)極(🏓)陀對峙的(de )局(🛫)面。又因亞極陀多(➿)次拯救G3，G3加入戰團(🌄)對付(fù )磯烙(lào )使。可惜G3聯手(shǒu )亞極(jí )陀未敵磯(😎)烙(lào )使，警方(fāng )有(yǒu )見及(🤬)此更厲害(♿)的(de )武器－(🥡)G3-X。在(zài )G3-X和(hé )亞極陀合(📩)作(zuò )下，未確認生命體(tǐ )雖然愈來愈厲害，但也(yě )被(bèi )擊倒。
　　(🈹)第三個幪面(🎦)超人是(🛳)由(yóu )木野薰變身，他雖然會優先對付未確認(rèn )生命體，但亦會對付(🏃)磯烙使(shǐ )和亞極陀，因他認為(wéi )世上(shàng )有(yǒu )他(⤴)就夠了(le )。後來(lái )他被強化了的磯烙(✝)使所(🗒)敗，又被涼所(suǒ )救而作(🍀)出(🥩)改變(🚩)。
　　原(🎄)來謎(📘)的青(qīng )年是遠(yuǎn )古使用(yòng )闇力量的創造主，他(🚔)今次派出(chū )水的精(jīng )靈對付(🔢)三個幪面超(📏)人及G3，起初四(📐)人(🥂)不敵，但翔(xiáng )一打破恐(👘)懼，令(🐮)亞極(🌚)陀的(🔀)力(lì )(🥗)量(liàng )再上(🚁)一層(🀄)，再合四人之(zhī )力，將(jiāng )他打敗(bài )。
　　在警方(fāng )和(hé )真魚的調查下發現翔一(⚾)的(de )姐姐木雪(✝)菜也(🧑)曾(céng )(🔦)經變(🐻)成亞極(🧜)陀，而(🍺)其他擁有超能力的人最(zuì )終也會(😛)變成亞(yà )極(jí )陀，真魚更發(🚑)現她的父(fù )親(🛴)的死和亞極陀有關而(ér )疏(shū )離(lí )翔(xiáng )一(🔼)。這時闇的(📘)創造主親自出(📿)擊，要收回翔一(yī )等的力量。更決(🎓)定殺(shā )(👰)盡所有(yǒu )人類，以(⚡)免(🎷)有更多(duō )(🐇)的(de )亞極陀誕生(shēng )。他派(pài )出(♟)風(✒)、地、水(🛵)三(sān )精靈(líng )，翔一(yī )、涼和誠的最後一(📎)戰(🏗)在此(cǐ )展開。