(🕕)位于东京西(xī )部的巨(jù )大“学(📒)园都市”。在总人口(🕟)达230万(wàn )人，其中约8成(🆖)是(shì )学生的这座都市中，实施着超(chāo )能力开发(🎲)的特殊课程，学(xué )生(shēng )们的(⚫)能力被给予从(🤷)“无能力Level 0”到“超(chāo )能(néng )力Level 5”的六(liù )(🙁)阶段评价。
　　(💞)高(gāo )中生(🌙)上条当麻(🔩)，也是住(🚨)在学(⏯)园(😞)都市的(❔)学生(shēng )之(🌑)一。他由于隐(💻)藏(cáng )在右手中(✋)的力量——(🤸)只要是异能之力，就连神的加(jiā )护都能消除的“幻(huàn )想杀(shā )手Imagine Breaker”，而被评价为(💹)名落孙山(🍑)的“无(💍)能力”，过着充满不幸(xìng )的(🐨)人生(🥋)。
　　而上条的学生生(shēng )活，由(yóu )于暑(🔍)假开始时从天而(💏)降(jiàng )的(de )纯(chún )白(👵)修(♌)女而(🥅)发(🐞)生(shēng )了巨(jù )大的变化(🔎)。自(🔙)从与(yǔ )逃离(lí )“魔法”世界的(📞)她——“禁书目(mù )录茵蒂克丝(📤)”相遇开(kāi )始，上(⏺)条就被卷入(❓)了各种各样的事(shì )件中。统率学园(yuán )都市(shì )的“科(🈳)学”方、与(yǔ )茵(yīn )蒂(dì )克(kè )丝(sī )关联的“魔法”方(🏡)，在惊(jīng )险地解决双(🕵)方事件的过程(👆)中，他的(🗒)人(🏆)际(jì )关系(xì )也逐步(🏖)扩展。之后，魔法一(🈺)方的十(shí )字教最(😻)大(♈)宗派(🍗)罗马正教，终(😙)于(yú )注意到上条的存(cún )在……(👅)。
　(🍂)　如(🌸)同(tóng )呼应魔法方(fāng )一(yī )般，科学(xué )方的(de )学园(yuán )都市也有所(suǒ )动作。但也(🤙)有(💘)与逐渐(jiàn )开(🤫)始对立的世(shì )界动(🔭)向抗争的人(🕠)不断出现(xiàn )。那些(xiē )通过与上条有所(🧖)关(guān )联，而使命运大为改变(biàn )的(🈲)“英雄”们。
　　他们挺身(shēn )而出(chū )与(yǔ )世界(jiè )对峙。如同上条当麻做(⏫)过的(📦)那(😋)样。
　　科学与魔法第三次(cì )交织(zhī )之时，故(gù )(🌔)事(🍢)将大幅(fú )推进！！