位于(yú )(🌠)东京西部的巨(🐽)大“学(📒)园都(🐌)市”。在总人口达230万人，其中约8成是学(xué )(🐉)生的这座都市中，实施着超能力开发的特(❣)殊课程，学生(🚤)们的能力被给予从“无(🛍)能(néng )力(🕖)Level 0”到(dào )“超能(néng )力Level 5”的六阶段(🚸)评价(🚑)。
　(🔊)　高中生上(shàng )条当麻，也是住(zhù )在学园都(🖲)市的学生之一。他由于隐藏在右手(shǒu )中(zhōng )的力(lì )量(liàng )——只要是异(yì )能之力(💪)，就连神(🈴)的(🍄)加护都能消(🧤)除的“幻想(⛳)杀(😍)手Imagine Breaker”，而被评(píng )价为(💹)名落孙山的“无能力”，过着(zhe )充满不(🌹)幸(⛏)的人(👪)生。
　　而上条(tiáo )的学(🙎)生(shēng )生活，由于暑假开始时从天而(💏)降(📸)的纯白(bái )修女(💸)而(🥅)发生了巨(jù )大的(de )变(📐)化。自(🔙)从与逃(táo )离“魔法(fǎ )”世界(🌸)的(de )她(⏳)——“禁书目(mù )录(🕕)茵蒂克丝”相遇开始，上条就(🧘)被(bèi )(💅)卷入(rù )了各种(zhǒng )各样的(😉)事件中(zhōng )。统(tǒng )率(❄)学园都市(🧥)的“科(kē )学(xué )”方、(🔍)与(yǔ )茵蒂克(kè )丝关联(lián )的“魔法(🐅)”方(🏡)，在(💨)惊(🈸)险地解(jiě )决双(shuāng )方事件的过程中，他的人(rén )际关系也逐(zhú )步(bù )扩(kuò )展。之后(hòu )(🏗)，魔法(fǎ )一方的(de )十(shí )字教最大宗派罗马(mǎ )正(🐑)教，终于注意到上条的(de )存在(🌲)…(🌽)…。
　(🍂)　如(rú )同呼应魔(mó )法(fǎ )方一般，科(kē )学(🏓)方的学园都市(📛)也有所动作。但也有与逐渐开(kāi )(🤫)始对立的世界动向抗(😯)争的人不断(duàn )出现。那(nà )些通过与上条(😎)有所关(🌥)联(lián )，而(ér )使命运大为改变的“英雄”们。
　　他们挺(tǐng )身而出与(☔)世界对峙(🚄)。如(rú )同上(🏥)条(tiáo )当(📒)麻(🍑)做过的那(😋)样。
　　科学与魔(mó )法第(dì )(🈶)三次交(🐞)织(zhī )之时，故(gù )事将(jiāng )大幅(🔉)推进！！